以下的部分為主機安裝Ubuntu系統及Gromacs系統安裝之教學
銘傳大學的學生若是申請利用銘傳大學雲端教室之主機，可參考下列連結之教學
而非利用銘傳大學雲端教室主機者，可參考以下之主機申請、Ubuntu系統安裝及Gromacs系統安裝之教學方法
銘傳大學 — 主機申請教學
任一銘傳大學學生皆可利用學校資源進行主機申請
Step 1：進入銘傳大學學生資訊系統，於「快速連結」處找到「雲端教室」並點選；或進入銘傳大學Moodle數位教學平台，於「資網服務」處找到「雲端教室」並進行點選。
Step 2：進入雲端教室系統後以銘傳大學之moodle帳號、密碼登入。
Step 3：登入雲端教室系統後，欲申請主機請選擇「申請及管理雲端主機」之選項。
Step 4：進入後點選於「管理專案計畫」下之「申請專案」。
Step 5：填寫專案申請目的，包括「計畫名稱」、「計畫目標」以及「成果指標」，填寫完後點選於頁面下端之「申請」。
Step 6：將申請資料送出後即表示已完成專案之申請，並請等候e-mail通知。
於專案到期前需撰寫結案報告進行審核
Step 1：進入雲端教室系統後選擇「申請及管理雲端主機」，並點選「結案報告」之選項，以進行結案報告之撰寫。
Step 2：確實撰寫結案報告後進行「提交」，並等待e-mail通知。
如需繼續執行專案可於此專案結束後在規定時間內重新申請主機，並選擇「續用主機」後即可進續進行專案。
詳細教學圖文可參考以下連結